Από τα φοιτητικά του χρόνια δραστηριοποιήθηκε πολιτικά και εντάχθηκε στο ΚΚΕ Εσωτερικού, στη συνέχεια υπήρξε από τα ιδρυτικά μέλη της Β Πανελλαδικής και αργότερα, ως ανένταχτος στην Ριζοσπαστική Αριστερά , με δράση στα πολιτικά και κοινωνικά κινήματα .
Συμμετείχε σημαντικά στην δημιουργία της κοινωνικοπολιτικής-πολιτιστικής κίνησης Κορυδαλλού ΠΑΡΕΜΒΑΣΗ , επίσης στο ΡΑΔΙΟ-ΠΑΡΕΜΒΑΣΗ είχε εκπομπή πολιτικού σχολιασμού.
Είναι πρόεδρος της Β΄ ΕΛΜΕ ΠΕΙΡΑΙΑ ( σχολεία Κορυδαλλού ) και αναπληρωτής συντονιστής της Ο.Μ ΣΥΡΙΖΑ ΚΟΡΥΔΑΛΛΟΥ και μέλος της νεοϊδρυθείσας συνδικαλιστικής παράταξης Μ.Ε.Τ.Α ( Μαχητική Εργατοϋπαλληλική Ταξική Ανατροπή).
Ο Γιάννης Βαρδουνιώτης είναι υποψήφιος Δημοτικός Σύμβουλος με την Ανοικτή Δημοτική Κίνηση “Πάμε Αλλιώς” και την Καίτη Κυλάκου.
